Es un centro de investigación que tiene como uno de sus principales objetivos fortalecer el campo de la investigación evaluativa en el área de la salud pública. CEDETES contribuye a la creación de capacidad institucional y formación de investigadores para desarrollar teoría y enfoques metodológicos alrededor de la evaluación de intervenciones en salud pública.
En particular, CEDETES tiene como objetivo desarrollar, implementar y validar metodologías de evaluación y producción de evidencias sobre efectividad y costoefectividad de políticas, programas e intervenciones en salud pública. Se enfoca en la generación de evidencias e información como insumo para la formulación, implementación y evaluación de intervenciones en salud pública.